Ну, как-бы, да. Я же не зря про бинарный формат исполнямых файлов говорил.я так понимаю, что мне её компилировать надо ещё раз и работать всё будет.
Так что осваивайте GCC.
Есть ещё вариант - если ваша программа была скомпилирована для Win, то её можно попробовать запустить в среде Linux с помощью эмулятора wine.