дай бог помяти но давненько у меня была примерно похожая ситуация.
машина стояла на учете в нашем ГАИ, сама находилась в Кыштыме и не двигалась, покупатель так же жил в Кыштыме. механизм снятия ТС с учета был такой: в Кыштыме договаривался с инспектором МРЭО вез его к машине, он на месте осматривал, потом в МРЭО выписывал мне справку о том что ТС такой-то, номера такие-то с припиской что ТС не исправна и недвижима (примерно такой текст). Затем я с этой справкой со всеми документами на ТС и гос. номерами шел в наше ГАИ где проходил обычную процедуру снятия ТС с учета. После получения документов о снятии с учета ехал в Кыштым где передавал все (неисправное ТС, документы на ТС) новому владельцу и вроде ВСЕ.